是的，在电视剧《一起又看流星雨》的大结局中，云海最终回来了。

在剧情中，云海在离开后，雨荨一直在寻找他。后来，当雨荨准备去欧洲找云海时，她发现自己的手机遗失在了家里。就在她返回家寻找手机的时候，云海奇迹般地回来了，出现在雨荨的面前。原来，蒋媛发现这样的方式得到云海没有任何意义，所以选择了放手。

此外，其他信息也证实了云海的回归。例如，蒋媛在欧洲小镇的一栋别墅内明白未来自己的幸福将和云海没有任何关系了。最后，所有的齐聚学校，为端木祈祷，于馨推着康复的端木出现在大家的面前，端木的病治愈了，恢复了健康。

因此，可以确定在《一起又看流星雨》的大结局中，云海确实回来了。