《火影忍者》的动漫剧情可以大致划分为以下几个阶段：

初期阶段（1-25集）

鸣人登场和中忍考试第一场。

鸣人与佐助、小樱成为卡卡西的组员，第七班组成。

波之国篇章，与再不斩和白的战斗。

成长与冲突阶段（27-51集）

第二场中忍考试开始到小李败于我爱罗。

鸣人修行与风之国阴谋。

大蛇丸进攻木叶，三代火影战死。

佐助离开木叶，投靠大蛇丸，佐助与鸣人在终结之谷决战。

自来也的登场与三忍大战（53-96集）

自来也登场。

鸣人激战白眼到三忍大战。

纲手继承火之意志。

第四次忍界大战前期（98-165集）

鸣人佐助冲突到佐助出走鸣人鹿丸追击。

五影会谈到第四次忍界大战开端。

鸣人九尾试炼开始。

正式开战。

鬼刀7人众登场。

火影雷影拦截鸣人上战场。

鸣人正式参战恐怖水影。

霸气斑爷登场。

宇智波两兄弟大战蛇仙人。

柱间与斑的过去到第七班集结。

十尾人柱力。

宇智波斑会和宇智波带土。

鸣人佐助到了死亡边缘。

苍蓝猛兽开八门暴揍六道斑。

疾风传开始与晓的进攻（221-276集）

疾风传开始。

晓的进攻阿斯玛战死。

佩恩抓捕鸣人进攻村子。

佩恩诞生由来到鸣人成为英雄。

第四次忍界大战中期与后期（333-498集）

自来也潜入晓基地到佐助捕获八尾。

火影雷影拦截鸣人上战场。

鸣人正式参战恐怖水影。

霸气斑爷登场。

宇智波两兄弟大战蛇仙人。

柱间与斑的过去到第七班集结。

十尾人柱力。

宇智波斑会和宇智波带土。

鸣人佐助到了死亡边缘。

苍蓝猛兽开八门暴揍六道斑。

无限月读。

大筒木辉夜登场与封印（671-699集）

大筒木辉夜登场到封印大筒木辉夜。

终结谷之末与少年时代篇（695-703集）

终结谷之末。

少年时代篇。

这些阶段涵盖了《火影忍者》的主要剧情发展，从鸣人的成长与奋斗，到与佐助的深厚羁绊，再到第四次忍界大战的宏大场面，最终到辉夜的登场和封印，整部作品充满了成长、复仇与救赎的主题。