证券公司机构业务部的主要职责包括：

创新业务或中间业务开拓：

负责营业部创新业务或中间业务的开拓，包括但不限于股权质押融资、新三板、投行业务、通道类业务等，并完成公司下达的目标任务。

重点战略客户开发与维护：

负责私募公司、信托公司、基金公司、保险公司、财务公司、高净值客户等重点战略客户的开发与维护。

信息收集与整理：

负责营业部所属辖区战略客户的信息收集与整理，建立战略客户信息数据库，全面了解并分析客户的个性化需求，提供一站式的综合金融服务方案。

创新业务模式开发：

积极寻求、开拓、建立创新业务模式，开发新产品，开拓新市场。

企业融资服务：

承揽企业融资类业务，包括IPO、再融资、并购重组、债权融资、新三板推荐挂牌、新三板转持续督导、资产证券化、一级股权投资、另类股权及其他投资、跨境股权融资、跨境债权融资等。

资本市场服务：

涉及投资银行部、资本市场部、并购部等，负责企业融资、并购、重组等业务，通过提供手续费盈利。

交易渠道与客户服务：

为投资者提供交易渠道，销售股票债券和股票债券的经纪业务，包括开发和招揽客户、向客户进行理财产品销售等。

其他专业服务：

包括托管外包、股权质押、财务顾问、发债等主要为机构客户提供的一篮子服务业务。

总结来说，证券公司机构业务部的主要职责是开拓和维护机构客户，提供综合性的金融服务方案，包括创新业务、企业融资、资本市场服务和其他专业服务。这些职责旨在帮助证券公司拓展市场份额，增加收入，并提升客户满意度。