学习时感到痛苦的原因是多方面的，包括生理、心理和社会文化等因素：

进化本能与大脑能耗

从进化的角度来看，人类祖先在茹毛饮血的年代，长时间坐下来学习并不符合生存法则。因此，现代人类在学习时，身体仍在渴望运动，而大脑却要处理复杂的任务，这种矛盾导致学习成为一种痛苦的经历。

学习是一项高能耗的活动，大脑虽然只占体重的2%，却消耗了身体20%的能量。解复杂问题或理解抽象概念时，脑细胞会高度活跃，这种高消耗会让人感到疲惫，从而将学习与痛苦联系在一起。

社会文化的高压

社会文化对学习的期望很高，家长和老师们常常灌输“学习改变命运”的观念，成绩成为衡量人生价值的重要标准。这种压力使得学习不再仅仅是吸收知识，而是与未来的成功紧密相连，增加了心理负担。

在学校教育体系中，许多学校仍然采用“填鸭式”教学法，课堂内容缺乏与实际生活的关联，学生被动接受信息，导致知识枯燥乏味，进一步增加了学习的痛苦感。

内在动机的缺失

当人们对某件事情有内在兴趣时，做这件事情会变得轻松且愉悦。然而，如果学习任务过于复杂或难以理解，缺乏动力和自律性，就会感到痛苦。

学习的长强度和时间跨度也会让人感到痛苦，特别是当学习内容与个人的兴趣和需求不匹配时。

物理学的熵增原理

物理学中的熵增原理告诉我们，自然界中的事物都倾向于朝着混乱度增大的方向发展。而学习的过程是将原本杂乱无章的知识归纳整理成系统的体系，这是一个熵减的过程，需要人为的强制干预。这种强迫自己集中注意力、记忆、做题等努力，与人性中追求舒适和轻松的本能相违背，因此学习是痛苦的。

教育体系的弊端

现代教育体系存在诸多问题，如教材编写混乱、教学方法陈旧、评价体系单一等，这些因素共同作用，使得学生在学习过程中感到痛苦和压力。

心理压力与愧疚感

在成绩主导的评价体系下，学生常常因为成绩不佳而感到挫败和失落，这种长期的压力和挫败感会逐渐消磨对学习的兴趣和信心。

家庭对学习成绩的期望也会给学生带来巨大的心理压力，特别是当学生未能达到父母的期望时，会产生愧疚感，进一步加重学习的痛苦。

综上所述，学习时感到痛苦的原因是多方面的，既有生理上的原因，也有心理和社会文化上的原因。要减轻学习的痛苦，需要从改进教学方法、调整评价体系、增强学生的内在动机等方面入手，同时学生自身也要学会调整心态，劳逸结合，找到适合自己的学习方法。