二战时期，日本和美国并非是一起的。虽然日本在二战期间与美国存在一些合作，例如在战争末期，日本向美国投降前，双方私下达成多项协议，包括不怪罪天皇、庇护战犯等，并且日本把731部队的研究资料移交给美国，原731部队成员也大量加入美国，为美国研究细菌武器。但这些合作并不能说明两国是一起的。

中美两国在二战中是抗击日本法西斯的主力，但表现大相径庭。中国被日本打得节节败退，而美国则对日本进行了有效的打击。此外，美国在日本派驻军队，在一定程度上是为了遏制苏联的扩张。

二战结束时，美国和苏联都没有将日本分裂成两个国家。虽然当时美苏关系已经开始恶化，双方之间的冷战正在逐渐升级，但他们没有足够的信任来共同管理一个分裂的日本。相反，美国和苏联都希望控制日本，并利用它作为在亚太地区的一个重要盟友。因此，将日本分裂成两个国家可能会削弱它的军事和经济实力，使其无法成为美国和苏联的重要盟友。

综上所述，尽管二战期间日本和美国在某些方面存在合作，但他们并非是一起的，而是各自为了自身利益而进行战争。